Gluma I

Balet se otvara u Darlingovoj dječjoj sobi. Ugodan je prizor dok se Michael, John, Wendy i njihov pas Nana igraju posljednji put pred večernju gužvu. Gospodin i gospođa Darling ulaze u svoju spavaću sobu s lipom, lizom i pripremaju djecu za krevet. Gospodin i gospođa Darling odlaze na večeru nakon što djeca budu smještena.

Kad djeca napokon zaspe, roditelji odlaze i sluškinja se vraća u njezine odaje. Nakon što se stvari smiruju, Tinkerbell, vila Petera Pana, leti kroz otvoreni prozor i Peter Pan brzo slijedi. Peter Pan bijesno traži svoju izgubljenu sjenu. On pronalazi njegovu sjenu, ali ne može učiniti da se drži za njega. Wendy se budi da vidi dilemu Petera Pana.

Izvadi iglu i konac i zajedno sašije Petra Pana i njegovu sjenu. John i Michael napokon se probude do večernjih uzbuđenja. Peter Pan, uz pomoć Tinkerbellove vilinske prašine, podučava ih sve kako letjeti. Djeca lete kroz prozor prateći Petera Panu u "Never Never Land".

Wendy, Michael, John, Peter Pan i Tinkerbell stižu u Never Never Land navečer. Tinkerbell leti do Tootlea, jednog od Izgubljenih dječaka, i govori mu da je Peter Pan sa sobom donio neki plijen. Tootle vadi luk i strijelu i upuca Wendy s neba. Kad im Peter Pan kaže što su učinili, shvatili su da ih je Tinkerbell iz ljubomore prevario.

Tinkerbell liječi Wendy i slijedi proslava. Njihovo se slavlje, međutim, prekida kad kapetan Kuka i njegov posjed izađu na scenu. Izgubljeni dječaci se raspršuju po šumi. Kapetan Kuka želi se boriti samo s Petrom Panom. Kad se počnu svađati, kapetan Kuka čuje glasno zveckanje. Shvaća da je krokodil taj koji mu je ugrizao ruku i progutao sat. Kapetan Kuka i njegova posada bježe na svoj brod.

Akt II

Povratak u dom Izgubljenih dječaka Wendy priprema večeru i čita im priču nakon što su jeli. Nakon što se Dječaci povuku u svoje krevete, Wendy i Peter ostaju sami. Počinju se zaljubiti, ali Peter Pan vraća se svom maloljetničkom jastvu i leti do svog kreveta. Wendy hvata svoju iglu i konac i popravlja dječačku razderanu odjeću. Nakon nekog vremena zaspi. Trenutak kasnije, kapetan Kuka i njegova posada provaliju u dom i oteli svu djecu, osim Petera Pana - kapetan Kuka ga nije mogao pronaći. Peter Pan se budi i pronalazi sve nestale. Tinkerbell mu brzo objasni što se dogodilo.

Peter Pan i Tinkerbell lete na brod kapetana Kuka, Jolly Roger. U međuvremenu, kapetan Kuka i njegova posada slave ono što oni misle da je njihova pobjeda. Počinju gurati djecu da hodaju daskom, gdje ispod nje čeka krokodil. Peter Pan im dolazi u pomoć prije nego što djecu gurnu preko broda. Između Petera Pana i kapetana Kuke vodi se velika borba. Na kraju se kapetan Kuka nadjača i padne u vodu s krokodilom. Izgubljeni dječaci preuzimaju brod sad kad gusari nemaju vođu. Peter Pan, Tinkerbell, Izgubljeni dječaci, Clara i njezina braća slave svoju pobjedu.

Proslava umire i Wendy shvaća da je poprilično udomljena. Ne želi zauvijek ostati dijete; želi ići kući. Clara i njezina braća svima se oproštaju. Tinkerbell posipa njihovu vilinsku prašinu po njima i oni odlete kući.

Wendy, Michael i John dolaze kući kako bi pronašli gospodina i gospođu Darling, zajedno s Lizom i Nanom, obuzeti tugom zbog njihovog nestanka. Čim se pojave, svi su sretni i slijevaju suze radosti. Wendy je pitala Petera Pana želi li se vratiti s njom, ali za razliku od Wendy, nije želio odrasti.